Uno dei pochi archivi che ha superato le vicende della Seconda Guerra Mondiale, le distruzioni, i terremoti è quello della Deputazione della Cappella del Tesoro di San Gennaro. Per un voto della Città del 1527, fu costruita una sede degna delle reliquie di San Gennaro conservate nel “Tesoro vecchio” insieme a quelle dei “santi vescovi” di Napoli.

Nell’archivio della Deputazione è possibile trovare delibere che riguardano il carattere laico della gestione accanto alle “scritture ecclesiastiche”.

I mezzi di corredo dell’archivio si basano sull’inventario compilato da Renata Orefice e Jole Mazzoleni negli anni settanta e su una successiva, parziale informatizzazione realizzata negli anni novanta. È in corso di realizzazione un progetto che permetterà la costituzione di una banca dati che, su base cronologica, potrà rispondere a tutte le domande degli studiosi.